Les médias parlent régulièrement de microbiote, un mot inconnu il y a quelques années. Ce terme désigne l’ensemble des micro-organismes (principalement des bactéries) qui vivent en étroit rapport avec nous, sur la surface de notre peau, sur nos muqueuses et dans nos intestins.

Il se constitue dès notre naissance, et diffère si l’on naît par césarienne ou par voie basse.

Le microbiote atteint un équilibre lors de la petite enfance pour rester relativement stable durant de nombreuses années. Mais il peut changer de manière importante si l’on modifie son régime alimentaire, si l’on voyage dans d’autres régions du monde ou si l’on prend des antibiotiques.

De nombreuses études ont permis d’associer certaines maladies à des changements du microbiote intestinal. Grâce à ces découvertes, nous pourrions envisager le diagnostic précoce de ces maladies, voire leur prévention ou leur traitement en modifiant la composition du microbiote, si ce dernier joue un rôle actif dans le développement de ces affections.

De même, les techniques utilisées pour l’analyse du microbiote (séquençage de nouvelle génération) permettent de développer de nouveaux outils diagnostics.